Clase	Orden	Familia	Nombre científico	Nombre común	Categoría de riesgo NOM-059-SEMARNAT-2010
Mammalia	Artiodactyla	Antilocapridae	Antilocapra americana	Berrendo	En peligro de extinción
Mammalia	Artiodactyla	Cervidae	Mazama americana temama	Venado temazate rojo
Mammalia	Artiodactyla	Cervidae	Mazama pandora	Venado temazate café
Mammalia	Artiodactyla	Cervidae	Odocoileus hemionus	Venado bura	Subespecie cerrosensis: En peligro de extinción Subespecie sheldoni: Amenazada
Mammalia	Artiodactyla	Cervidae	Odocoileus virginianus	Venado cola blanca
Mammalia	Artiodactyla	Ovidae	Bison bison bison	Bisonte americano	En peligro de extinción
Mammalia	Artiodactyla	Ovidae	Ovis canadensis	Borrego cimarrón	Sujeta a protección especial
Mammalia	Artiodactyla	Tayassuidae	Tayassu pecari ringens	Pecarí de labios blancos	En peligro de extinción
Mammalia	Carnivora	Canidae	Canis lupus baileyi	Lobo mexicano, Lobo gris	Probablemente extinta en el medio silvestre
Mammalia	Carnivora	Felidae	Panthera onca	Jaguar	En peligro de extinción
Mammalia	Carnivora	Mustelidae	Enhydra lutris	Nutria marina	En peligro de extinción
Mammalia	Carnivora	Mustelidae	Lontra longicaudis	Nutria de río	Amenazada
Mammalia	Carnivora	Otariidae	Arctocephalus townsendi	Lobo fino de Guadalupe	En peligro de extinción
Mammalia	Carnivora	Otariidae	Zalophus californianus	Lobo marino de California	Sujeta a protección especial
Mammalia	Carnivora	Phocidae	Mirounga angustirostris	Elefante marino	Amenazada
Mammalia	Carnivora	Phocidae	Phoca vitulina richardii	Foca común, Lobo marino pinto	Sujeta a protección especial
Mammalia	Carnivora	Ursidae	Ursus americanus eremicus	Oso negro (incluye también la población de Sierra del Burro, Coahuila)	En peligro de extinción (la población de Sierra del Burro, Coahuila, está Sujeta a protección especial)
Mammalia	Cetacea	Balaenopteridae	Balaenoptera musculus	Ballena azul	Sujeta a protección especial
Mammalia	Cetacea	Balaenopteridae	Balaenoptera physalus	Rorcual común, Ballena de aleta	Sujeta a protección especial
Mammalia	Cetacea	Balaenopteridae	Megaptera novaeangliae	Ballena jorobada	Sujeta a protección especial
Mammalia	Cetacea	Delphinidae	Tursiops truncatus	Tonina, bufeo, Delfín nariz de botella, Tursión	Sujeta a protección especial
Mammalia	Cetacea	Eschrichtiidae	Eschrichtius robustus	Ballena gris	Sujeta a protección especial
Mammalia	Cetacea	Phocoenidae	Phocoena sinus	Vaquita marina	En peligro de extinción
Mammalia	Chiroptera	Phyllostomidae	Leptonycteris nivalis	Murciélago magueyero mayor, Murciélago hocicudo mayor	Amenazada
Mammalia	Chiroptera	Phyllostomidae	Leptonycteris yerbabuenae	Murciélago magueyero menor
Mammalia	Lagomorpha	Leporidae	Lepus callotis	Liebre torda
Mammalia	Lagomorpha	Leporidae	Lepus flavigularis	Liebre de Tehuantepec	En peligro de extinción
Mammalia	Lagomorpha	Leporidae	Lepus insularis	Liebre negra	Sujeta a protección especial
Mammalia	Lagomorpha	Leporidae	Romerolagus diazi	Zacatuche, Teporingo, Conejo de los volcanes	En peligro de extinción
Mammalia	Lagomorpha	Leporidae	Sylvilagus graysoni	Conejo de Tres Marías	En peligro de extinción
Mammalia	Lagomorpha	Leporidae	Sylvilagus insonus	Conejo de Omiltemi	En peligro de extinción
Mammalia	Lagomorpha	Leporidae	Sylvilagus mansuetus	Conejo de San José	En peligro de extinción
Mammalia	Perissodactyla	Tapiridae	Tapirus bairdii	Tapir centroamericano	En peligro de extinción
Mammalia	Primates	Atelidae	Alouatta palliata	Mono aullador, Saraguato de manto	En peligro de extinción
Mammalia	Primates	Atelidae	Alouatta pigra	Mono aullador, Saraguato yucateco	En peligro de extinción
Mammalia	Primates	Atelidae	Ateles geoffroyi	Mono araña	En peligro de extinción
Mammalia	Rodentia	Castoridae	Castor canadensis	Castor	En peligro de extinción
Mammalia	Rodentia	Sciuridae	Cynomys ludovicianus	Perrito de las praderas, Perro llanero cola negra	Amenazada
Mammalia	Rodentia	Sciuridae	Cynomys mexicanus	Perrito de las praderas, Perro llanero mexicano	En peligro de extinción
Mammalia	Rodentia	Sciuridae	Glaucomys volans	Ardilla voladora, Ardilla planeadora	Amenazada
Mammalia	Sirenia	Trichechidae	Trichechus manatus	Manatí del Caribe	En peligro de extinción