Región Hidrológica Prioritaria	Entidad federativa	Superficie (km2)	Recursos hídricos principales
Anillo de cenotes	Yucatán	16,214.82	Lénticos: cenotes, lagunas costeras, marismas, ciénegas, petenes; lóticos: ríos y una extensa cuenca criptorréica de aguas subterráneas (Anillo de Cenotes)
Bahía de Ohuira - Ensenada del Pabellón	Sinaloa	4,433.79	Lénticos: llanuras de inundación, pantanos dulceacuícolas, lagunas, esteros; lóticos: ríos Culiacán, Sinaloa y Mocorito (cuencas bajas), ríos temporales, arroyos, drenes agrícolas
Bahía Magdalena	Baja California Sur	1,449.29	Lóticos: arroyos temporales, estuarios y canales
Balancán	Tabasco	2,131.08	Lénticos: pantanos, lagos; lóticos: ríos Usumacinta y San Pedro
Boca del Río Champotón	Campeche	730.92	Lóticos: río Champotón y arroyos
Cabecera del río Candelaria	Campeche	1,023.43	Lénticos: humedales; lóticos: río Candelaria
Cabecera del río Champotón	Campeche	1,718.46	Lóticos: río Champotón
Cabecera del río de La Laja	Guanajuato	3,476.00	Lénticos: presas Purísima, Begoña, El Gallinero y La Biznaga, humedales; lóticos: ríos de la Laja, El Plan y San Juan, arroyos temporales y permanentes
Cabecera del río Lerma	Estado de México	2,460.13	Lénticos: presas Antonio Alzate e Ignacio Ramírez, ciénega del Lerma, lagos, manantiales; lóticos: río Lerma
Cabecera del río Tonalá	Veracruz, Tabasco y Chiapas	3,196.09	Lóticos: río Tonalá y afluentesTancochapa o Pedregal, Xocuapan, Zanapa, El Blasillo y el Chicozapote, arroyos, manantiales
Cajón de Peñas - Chamela	Jalisco	7,556.48	Lénticos: presa Cajón de Peñas, lagunas, pantanos; lóticos: ríos Tomatlán, San Nicolás, Cuitzmala, Horcones, arroyos, esteros, manantiales
Cajón del Diablo	Sonora	2,784.93	Lénticos: aguajes; Lóticos: estero de Tastiola, ríos, arroyos temporales, manantiales
Calakmul	Campeche	4,171.03	Lénticos: charcas temporales; lóticos: pozos, corrientes subterráneas
Camacho - Gruñidora	Zacatecas, Durango y San Luis Potosí	16,976.38	Lénticos: presas, bordos ganaderos y agrícolas, lagos salinos; lóticos: río de Las Nieves o Grande, arroyos
Cenotes de Aldama	Tamaulipas	5,014.28	Lénticos: cenotes, lagos, reservorios; lóticos: río El Tigre y arroyos
Cenotes Tulum - Cobá	Quintana Roo	1,422.67	Lénticos: cenotes; lóticos: sistema de aguas subterráneas (única fuente de agua)
Chapala - Cajititlán - Sayula	Jalisco y Michoacán	6,150.42	Lénticos: lagos de Chapala, Sayula, Cajititlán, El Molino, San Marcos, Zacoalco, Atoyac, Atotonilco, Zapotitlán, La Magdalena, Camécuaro, presas Guaracha, Poncitlán, Jaripo, Corona y Colesio, Ciénega de Chapala, humedales, manantiales Los Negritos, La Luz; lóticos: ríos Grande de Santiago, Verde, Jiquilpan, Duero, La Pasión, Huaracha, Lerma y Zula, aguas subterráneas en los Valles y en las partes bajas de las cuencas hidrológicas
Chimalapas	Oaxaca y Chiapas	1,705.39	Lóticos: ríos Cintalapa, Encajonado, La Venta, Negro, Los Pericos, ríos subterráneos
Comitán - Lagunas de Montebello	Chiapas	2,300.69	Lénticos: lagunas de Montebello; lóticos: río Grande de Comitán y arroyos
Confluencia de las Huastecas	Veracruz, San Luis Potosí, Hidalgo y Querétaro	27,404.85	Lénticos: Presa Zimapán, lagos Meztitlán y Molango; lóticos: ríos Santa María, Bagres, Jalpán, de las Albercas, Naranjo, Mesillas, Tamuín o Pánuco, Grande de Meztitlán, San Pedro, Gallinas, Tampaón, Choy, Moctezuma, Ojo Frío, Tempoal o Calabazo, Tulancingo, Hondo, Amajac, del Hule, Axtla y Matlapa, arroyos, manantiales, cascadas, aguas hidrotermales
Cono Sur - Peto	Yucatán	1,076.47	Lénticos: cenotes; lóticos: aguas subterráneas
Contoy	Quintana Roo	2,785.20	Lénticos: laguna Yalahaú y Chacmochuk, lagunas costeras, ciénegas; lóticos: aguas subterráneas
Corredor Cancún - Tulum	Quintana Roo	1,715.00	Lénticos: lagunas de Chakmochuk y Nichupté, cenotes, estuarios, humedales; lóticos: aguas subterráneas
Cozumel	Quintana Roo	482.03	Lénticos: lagunas costeras, cenotes, humedales; lóticos: aguas subterráneas con una capa delgada de agua dulce
Cuatro Ciénegas	Coahuila	3,632.60	Lénticos: pozos artesianos, ciénegas, lagos-playa, pozas y lagos terminales, lagos Los Fresnos, Santa Tecla, Churince o Grande, San Marcos, La Escobeda, El Tío Cándido, Salada, Orozco, Anteojo, Ferriño, Tío Quintero, Chiqueros, Garabatal, San Pablo, Juan Santos, Los Hundidos, El Mojarral y otras (más de 200 pozas); lóticos: ríos Cañón, Garabatal, Puente Chiquito, Salado de Los Nadadores, Polilla, Churince o Pasos Bonitos, Positos, Mezquites, Puente Colorado, manantiales El Mojarral Este, Oeste y de En Med io, arroyos de Tormentas, canales de Julio, de Anteojo, de Orozco, de Nuevo, de la Angostura, de la Polilla, de Pozos, de la Becerra de Ferriño, de Saca del Fuente, de Escobeda y un complejo sistema de aguas subterráneas
Cuenca alta de los ríos Culiacán y Humaya	Durango y Sinaloa	10,367.54	Lénticos: presas Adolfo López Mateos y Sanalona, pantanos dulceacuícolas, charcas temporales, llanuras de inundación, brazos de río abandonados; Lóticos: ríos Culiacán, Tamazula, Humaya y Badiraguato, arroyos
Cuenca alta del río Conchos	Chihuahua y Durango	21,139.93	Lénticos: presas La Boquilla, Colina, San Miguel, Francisco I Madero, Torreoncillos, Talamantes, Parral, Canutillos y San Juan, Lagos Chancaplea, Las Arenosas, El Gigante, El Milagro, El Remolino y El Rincón; lóticos: ríos Florido, Conchos, San Pedro, Primero, El Álamo, Chuviscar, Parral, San Juan, Balleza, Nonoava, Matalotes y de Gallos
Cuenca alta del río del Carmen	Chihuahua	3,890.96	Lénticos: charcas temporales; lóticos: ríos del Carmen y Santa Clara, manantiales
Cuenca alta del río Fuerte	Sinaloa, Sonora y Chihuahua	29,441.00	Lénticos: presas Miguel Hidalgo, Josefa Ortíz de Domínguez, pantanos dulceacuícolas, charcas temporales, llanuras de inundación, brazos de ríos abandonados; lóticos: ríos Fuerte, San Miguel, Los Loera, Choix, Álamos, Chinipas, Urique, Tepochique, Oteros y Verde, arroyos, estuarios
Cuenca alta del río Ometepec	Guerrero	2,436.50	Lóticos: río Ometepec
Cuenca alta del río San Lorenzo - Minas de Piaxtla	Sinaloa y Durango	14,287.23	Lóticos: ríos San Lorenzo, Piaxtla, Elota, Hábitos y Los Remedios, ríos temporales, arroyos
Cuenca alta del río Sta. María	Chihuahua	4,395.32	Lénticos: presa El Tintero, lagos; lóticos: río Santa María
Cuenca baja del río Balsas	Michoacán y Guerrero	11,333.30	Lénticos: presas Infiernillo y La Villita, zonas inundables, pozos, esteros; lóticos: río Balsas y tributarios Tepalcatepec, Tacámbaro, Marqués y Zacatula, arroyos, manantiales
Cuenca baja del río Conchos	Chihuahua	3,536.33	Lénticos: presas Rosetilla y Luis L. León; lóticos: río Conchos, arroyos, humedales, manantiales
Cuenca media y alta del río Coatzacoalcos	Veracruz y Oaxaca	11,039.11	Lénticos: zona inundable de la cuenca media; lóticos: ríos Coatzacoalcos, Jaltepec y Sarabia, arroyos, pequeños manantiales
Cuenca media y alta del río Uxpanapa	Veracruz y Oaxaca	2,979.63	Lénticos: pozas y humedales; lóticos: ríos Uxpanapa y Nanchital, manantiales y arroyos
Cuenca Oriental	Puebla, Tlaxcala y Veracruz	4,958.60	Lénticos: lagos Totolango, Alchichica, San Luis Atexcac, La Preciosa, Aljojuca, San Miguel Tecuitlapa, Quechulac, Totolcinco y Ovando, pantanos de Tepeyahualco y presas; lóticos: ríos permanentes e intermitentes La Caldera, Xonecuila, Quetzalapa, Piedra Grande, arroyos temporales, manantiales El Carmen, Vicencio, Ojo de Agua, Lara Grajales, gran cantidad de aguas subterráneas
Cumbres de Monterrey	Nuevo León y Coahuila	2,603.06	Lóticos: río Santa Catarina, manantiales y arroyos
Delta del río Colorado	Baja California y Sonora	7,971.09	Lénticos: lago Salado, Ciénega de Santa Clara, estuarios, llanuras de inundación, pantanos, zonas permanentes; lóticos: delta del Río Colorado, arroyos, manantiales
El Guaje	Chihuahua y Coahuila	14,192.56	Lénticos: lagos el Guaje y Jaco, lagos Salinos, presas, bordos ganaderos y agrícolas; lóticos: ríos, arroyos
El Rey	Coahuila	12,030.68	Lénticos: lagunas el Rey, La Leche y El Coyote, lagos salinos, presas, bordos ganaderos y agrícolas; lóticos: arroyos y ríos
Humedales de Jilotepec - Ixtlahuaca	Estado de México	1,136.49	Lénticos: presas Danxho, Taxhimay, El Molino, Trinidad Fabela, de Palos, Huaracha, Nadó, San Antonio, Santa Elena, San Pedro, San Juanico, Tepetitlán, laguna de Huapango, bordos, lagos, manantiales termales; lóticos: ríos Lerma, El Molino, Ñadó, la Ladera, El Pescado, Coscomate, los Sabios, el Oro, los Arcos y arroyo Zarco
Humedales del Papaloapan, San Vicente y San Juan	Veracruz	8,186.98	Lénticos: laguna de Alvarado, Buen País y Camaronera; lóticos: sistema Papaloapan, ríos Papaloapan, San Juan Evangelista, San Vicente, San Agustín y Blanco
Humedales y lagunas de la Bahía de Chetumal	Quintana Roo	3,230.31	Lénticos: lagunas del Ocho, Bacalar, Xul-Há y Mariscal, cenotes, humedales, pantanos, bahías; lóticos: arroyos, sistema subterráneo con una capa delgada de agua dulce
Isla Mujeres	Quintana Roo	181.66	Lénticos: lagunas costeras, cenotes; lóticos: aguas subterráneas con una capa delgada de agua dulce
Isla Tiburón - Río Bacoachi	Sonora	10,027.41	Lénticos: presa Abelardo Rodríguez, lagunas; Lóticos: ríos Bacoachi, El Zanjón, San Miguel de Horcasitas y Sonora, arroyos temporales, manantiales
La India	Chihuahua, Coahuila y Durango	13,479.50	Lénticos: lago salino Palomas, presas, bordos, ganaderos y agrícolas; lóticos: río La India y arroyos
La Purísima	Baja California Sur	3,746.15	Lénticos: manantiales Paso Hondo, Ojo de agua, San Miguel, San Javier, ojos de agua San Isidro y la Purísima, presa El Rey; lóticos: arroyos temporales
La Sepultura - Suchiapa	Chiapas	2,396.77	Lóticos: río Suchiapa y arroyos
Lago Babícora	Chihuahua	2,270.61	Lénticos: lago Babícora, charcas temporales; lóticos: ríos San Miguel de Babícora y Piedras Verdes, manantiales
Lago Bustillos	Chihuahua	3,302.70	Lénticos: lago Bustillos, charcas temporales; lóticos: río Santa Rosa
Lago de La Media Luna	San Luis Potosí	1,293.51	Lénticos: lago de la Media Luna; lóticos: río Verde, arroyos, canales para riego
Lago Los Mexicanos	Chihuahua	884.16	Lénticos: lagos Los Mexicanos, San Rafael, charcas temporales; lóticos: ríos Satevo, Bacochi, arroyos temporales
Lagos cráter de Nayarit	Nayarit	676.05	Lénticos: lagos Santa María, San Pedro y Tepeltitic; lóticos: manantiales, arroyos
Lagos cráter del Nevado de Toluca	Estado de México	927.69	Lénticos: lagos Cráter El Sol y La Luna; lóticos: arroyos de montaña y manantiales
Lagos-cráter del Valle de Santiago	Guanajuato y Michoacán	3,478.03	Lénticos: 7 lagos-cráter: Hoya Rincón de Parangueo, Hoya San Nicolás, Hoya Estrada, Hoya Blanca, Hoya La Cintura, Hoya La Alberca, Hoya Álvarez y presa Solís; lóticos: río Lerma
Laguna Chichancanab	Quintana Roo y Yucatán	627.88	Lénticos: lagunas Chichancanab y Esmeralda
Laguna de Términos - Pantanos de Centla	Tabasco y Campeche	12,681.50	Lénticos: sistema lagunar estuarino de Términos, Pom, Atasta, Panlao, del Corte y San Carlos, El Viento, San Pedrito, Pajaral Primero, Pajaral Segundo, Sargazal, Tronconada, Cometa, Encantadita, San Isidro, Larga, El Quemado, Los Ídolos, Tacual, Guana, Paquial, Corcovado, La Puerta, Clara, Pastal y Puerto Escondido, humedales, pantanos permanentes y temporales, cuerpos acuáticos someros, estuarios; lóticos: cuenca baja de los Ríos Grijalva y Usumacinta, ríos San Pedro, San Pablo, Palizada, Candelaria, Chu mpán, Las Cruces, Las Piñas, Mamantel y tributarios
Llanos de Apan	Hidalgo y Tlaxcala	2,184.83	Lénticos: lagos-cráter de Apán, Jalene, Atoche, Tecocomulco y San Antonio de Atocha; lóticos: ríos San Miguel, Tecocomulco y Papalote, arroyos Columpio y Tizar
Los Azufres	Michoacán	1,319.15	Lénticos: presas El Bosque, Pucuato, Sabaneta y Mata de Pinos, manantiales; lóticos: ríos Zitacuaro, Hidalgo, arroyos
Los Tuxtlas	Veracruz	3,484.34	Lénticos: lagos de Catemaco, La Escondida, El Zacatal, La Encantada, Lagunas de Sontecomapa y del Ostión, lago cráter de San Martín; lóticos: ríos Grande de San Andrés, de la Palma, Salto de Eyipantla, arroyos Agrío y Coyame y manantiales de aguas carbonatadas
Malpaso - Pichucalco	Chiapas	3,734.93	Lénticos: presa Raudales de Malpaso o "Netzahualcoyotl", zonas inundables; lóticos: ríos de La Venta, Grande o Grijalva, de la Sierra y Pichucalco
Motozintla	Chiapas	2,587.12	Lóticos: ríos San Miguel y Chicomuselo
Mulegé - Santa Rosalía	Baja California Sur	2,422.02	Lénticos: presa La Misión; lóticos: arroyos de la Giganta y Mulegé, manantiales Santa Agueda, San Lucas, San Bruno y San Marcos
Oasis San Pedro de la Presa - El Pilar - Las Pocitas	Baja California Sur	5,186.52	Lénticos: oasís Santa Rita, San Hilario, San Pedro de la Presa y El Pilar-Las Pocitas; lóticos: arroyos Las Ánimas y El Pilar
Pátzcuaro y cuencas endorreicas cercanas	Michoacán y Guanajuato	7,092.87	Lénticos: lagos de Pátzcuaro, Zirahuén, Cuitzeo, Yuriria, San Gregorio, estanque "Las Condembas" en Opopeo, manantiales de Huandacareo, Copándaro, Santa Rita, San Juan Tararameo, de Araró, presas de Cointzio, Malpaís, Santa Clara, Umécuaro, Wilson, Loma Caliente y Xoconoles; lóticos: ríos Grande y Chiquito de Morelia, Lerma, Queréndaro, Tirio, Tiripetio, Charo, San Marcos, Caliente, Frío, San Lucas y Zinapécuaro, arroyos La Palma, Chapultepec, Santa Fé, Quiroga, Ajuno y Huintzio
Presa Miguel Alemán - Cerro de Oro	Oaxaca	4,299.36	Lénticos: presas Cerro de Oro (Miguel de la Madrid Hurtado) y Temascal (Miguel Alemán); lóticos: ríos Tonto, Usila, Petlapa y Santo Domingo, arroyos de alta pendiente
Presas río Turbio	Guanajuato	1,205.59	Lénticos: presas de Silva, El Coyote y San Antonio; lóticos: río Turbio
Remanentes del complejo lacustre de la cuenca de México	Distrito Federal y Estado de México	2,019.92	Lénticos: canales y lagos relictos de Xochimilco y Chalco, lagos de Texcoco y Zumpango, Ciénega de Tlahuac, vasos reguladores y de recreación; lóticos: ríos Magdalena, San Buenaventura, San Gregorio, Santiago, Texcoco y Ameca, arroyo San Borja, aguas subterráneas del sistema acuífero del Valle de México
Río Amacuzac - Lagunas de Zempoala	Morelos, Guerrero y Estado de México	7,924.72	Lénticos: lagos Coatetelco, Miacatlán, Zempoala, Tequesquitengo, el Rodeo y manantiales de aguas termales; lóticos: ríos Amacuzac, Tetecala, Tembembe, San Jerónimo, Tetlama o Yautepec, Jojutla, Chinameca o Cuautla y arroyos
Río Atoyac - Laguna de Coyuca	Guerrero	2,166.08	Lénticos: lagunas de Coyuca y Mitla; lóticos: ríos Atoyac, Coyuca y Camotal
Río Baluarte - Marismas Nacionales	Nayarit, Sinaloa, Durango, Jalisco y Zacatecas	38,768.73	Lénticos: presa Agua Milpa, Lagunas de Agua Brava, Teacapán, El Caimanero, Mezcatitlán, lagunas costeras, pantanos y más de 100 pequeños cuerpos; lóticos: ríos Baluarte, Cañas, Acaponeta, Rosamorada, San Pedro o Alto y Bajo Mezquital, Graceros, Grande de Santiago, Huaynamota, Matatán, Chapalagana, Jesús María, Bolaños , Valparaíso y un gran número de arroyos
Río Bravo - Piedras Negras	Coahuila	8,244.40	Lóticos: ríos San Antonio y San Rodrigo, manantiales, arroyos
Río Bravo Internacional	Tamaulipas, Nuevo León, Coahuila y Chihuahua	2,932.62	Lénticos: presas La Amistad, Falcón, Marte R. Gómez, Anzalduas, el Culebrón; lóticos: río Bravo
Río Hondo	Quintana Roo	2,688.54	Lénticos: cenotes, lagunas Milagros, Negra y Encantada, humedales; lóticos: ríos Hondo y Azul, arroyo Aguadulce, manantiales
Río La Antigua	Veracruz	2,326.43	Lóticos: ríos La Antigua, Jalcomulco y Santa María
Río Lacantún y tributarios	Chiapas	9,796.71	Lénticos: lagos El Ocotal, Lacanjá, Miramar, Ojos Azules, Escobar, Suspiro, El Tintal y otras; lóticos: ríos Usumacinta, Xabal, Lacantún, Aguilar, Chixoy, Lacanjá, Azul, Perlas, Jetjá, Negro-Tzendales, San Pedro y arroyos
Río Mayo	Sonora y Chihuahua	14,895.44	Lénticos: presa, pantanos, estuarios, charcas temporales, llanuras de inundación, brazos de ríos abandonados; lóticos: ríos Mayo, Moris y Cedros, arroyos, manantiales termales
Río Nazas	Durango	35,036.86	Lénticos: presas Lázaro Cárdenas, Francisco Zarco, el Palmito y Lago de Santiaguillo; lóticos: ríos San Juan, Ramos, Potreritos, del Oro, Nazas, Santiago, Tepehuanes y Peñón Blanco
Río Papagayo - Acapulco	Guerrero	8,501.81	Lénticos: lagunas Negra, La Sabana y Tres Palos; lóticos: ríos Papagayo, La Sabana y Omitlán
Río Salado de los Nadadores	Coahuila	9,541.83	Lénticos: lago Salinillas, Presa Don Martín o Venustiano Carranza; lóticos: ríos Salado de los Nadadores, Candela, Sabinas y Monclova, arroyos Aura, Seco y Pájaros Azules, manantiales
Río San Fernando	Tamaulipas	4,540.55	Lénticos: lagos de la Nacha y La Piedra, estuarios, humedales; lóticos: río San Fernando o Conchos, arroyos
Río San Juan y Río Pesquería	Nuevo León y Tamaulipas	13,724.34	Lénticos: presa Rodrigo Gómez "La Boca" y El Cuchillo; lóticos: ríos San Juan, Pesquería, de la Boca y Álamo, humedales, arroyos Escamilla y La Chueca, aguas subterráneas
Río San Pedro	Tabasco	1,317.55	Lóticos: río San Pedro
Río Tamesí	Tamaulipas	15,735.20	Lénticos: lagos Tortugas, Altamira, de Chairel y de la Culebra, humedales, cenotes; lóticos: ríos Tamesí, Sabinas, Mante y Guayalejo, arroyos de las Ánimas, Tantoán, Naranjo y Naranjal
Río Tecolutla	Veracruz y Puebla	7,950.05	Lénticos: presa Necaxa, estuario, laguna costera, marismas; lóticos: ríos Tecolutla, Necaxa, Laxaxalpa, Apulco y Tejocotal, arroyos
Río Tulijá - Altos de Chiapas	Chiapas y Tabasco	4,183.53	Lénticos: cascada de Agua Azul; lóticos: ríos Tulija, Encanto y Rascón
Río Verde - Laguna de Chacahua	Oaxaca	8,346.80	Lénticos: lagunas costeras de Chacahua, Pastoría, Miagua, Manialtepec y Espejo; lóticos: ríos Atoyac, Ocotlán, Verde, San Francisco y afluentes
Río Yaqui - Cascada Basaseachic	Sonora y Chihuahua	54,716.52	Lénticos: presas Álvaro Obregón, Plutarco Elias Calles y La Angostura, pantanos dulceacuícolas, estuarios, charcas temporales, llanuras de inundación, brazos de ríos abandonados, lagos; lóticos: ríos Yaquí, Cocopaque, Bavispe, Moctezuma, Chico, Tecoripa, Papigochic, Sahuaripa, arroyos, manantiales termales
Ríos Coalcomán y Nexpa	Michoacán	7,632.75	Lóticos: ríos Coalcomán, Nexpa y Carrizal
Ríos estacionales de Baja California - Cataviña	Baja California	3,658.47	Lóticos: arroyos intermitentes
Ríos Purificación y Armería	Jalisco y Colima	15,052.41	Lénticos: presas San Agustín y del Mojo, Laguna de Cuyutlán; lóticos: ríos Purificación, Cihuatlán, Armería-Ayuquila, Cohuayana, Ameca, Mananatlán y San Pedro, arroyos
Samalayuca	Chihuahua	19,113.28	Lénticos: lagunas Santa María, Guzmán y Patos, charcas temporales; lóticos: ríos Casas Grandes, Santa María, del Carmen y Janos, manantiales
San Blas - La Tovara	Nayarit	1,514.35	Lénticos lagos Tetepiltic y San Pedro, lagunas costeras, manglares; lóticos ríos San Blas-Hucila, La Tovara, La Tigrera y El Naranjo
San Pedro Mártir	Baja California	6,208.48	Lénticos: laguna Hanson, lóticos: ríos Rincón y Salado
Sian Ka'an	Quintana Roo	5,517.15	Lénticos: laguna Chunyaxche, cenotes, lagunas costeras, lagos, humedales, marismas; lóticos: canales, ríos subterráneos
Sierra de la Laguna y oasis aledaños	Baja California Sur	5,398.63	Lénticos: oasis Todos Santos, Migriño, Santiago y San Bartolo, Estero San José. Lagos, pantanos; lóticos: arroyos temporales
Sierra de la Libertad	Baja California	2,551.98	Lóticos: arroyos temporales
Sierra de San Francisquito - Oasis San Ignacio	Baja California Sur	4,262.91	Lénticos: laguna de San Ignacio; lóticos: río San Ignacio, estero San Juan, San Ignacio y El Cordón
Sierra de Santa Rosa	Coahuila	2,066.20	Lénticos: bordos, presas; lóticos: ríos La Babia y Salinas, arroyos, manantiales
Sierra del Novillo - La Paz	Baja California Sur	1,531.14	Lénticos: presa Buena Mujer, llanuras de inundación estacional; lóticos: arroyos el Cajoncito, El Calandrio, La Huerta, La Palma, El Novillo y Los Gatos, ríos estacionales y esteros
Soconusco	Chiapas	9,314.63	Lénticos lagunas de Buenavista, Zacapualco, de la Joya, El Viejo, Panzacola y Tembladeros, pantanos; lóticos: ríos Suchiate, Cahuatán, Coatán, Huixtán, Huehuetán, Cavo Ancho, Cintalapa, Doña María, Cacalupa, Sesecapa, San Nicolá+F408s, Bobo, Coapa, Pijijiapan, Nancinapa, Higuerilla, Mosquitos, Patos, Jesús, Parral, Amates, manantiales.
Subcuenca del río Asunción	Sonora	6,696.40	Lénticos: represas, oasís; lóticos: ríos Seco, Asunción, Altar, arroyos
Subcuencas de los ríos San Pedro y Santa Cruz	Sonora	2,810.66	Lénticos: embalses; Lóticos: ríos San Pedro y Santa Cruz, ríos temporales, arroyos
Sur de Campeche	Campeche	7,072.87	Lénticos: lago Noh; lóticos: río Candelaria
Valle de Aguascalientes - Río Calvillo	Aguascalientes, Jalisco y Zacatecas	5,046.11	Lénticos: presas Calles, Jocoqui, Jihuite, Niágara, del Rosario, La Codorniz, La Media Luna, La Dichosa, del Llavero y El Saucillo, bordos, reservorios, humedales, charcos, manantiales de aguas termales; lóticos: ríos Calvillo, Chicalote, Pabellón, San Francisco, Encarnación, Las Auras, Las Venas, Verde, Lagos, San Juan, Jalostotitlán, San Miguel y Paso Hondo
Valle Hundido	Coahuila	7,551.24	Lénticos: presas, lagos salinos, bordos ganaderos y agrícolas; lóticos: arroyos, ríos
Venado - Moctezuma	San Luis Potosí	1,171.90	Lóticos: manantiales
Zacapu	Michoacán	216.75	Lénticos: lago de Zacapu, manantial Bellas Fuentes; lóticos: río Angulo (efluente del lago de Zacapu)
Zona citrícola	Yucatán	678.06	Lénticos: cenotes; lóticos: aguas subterráneas